Служебная биография
Осенью 1547 г. в боярском списке назван среди бывших у князя Юрия Васильевича «в поезду» из Торжка (Назаров В.Д. О структуре Государева двора в середине XVI в. // Общество и государство феодальной России. Сб. статей, посвященный 70-летию академика Л. В. Черепнина. М., 1975. С. 53).
Тысячник 3-й статьи из Торжка. В Дворовой тетради из Торжка (Тысячная книга 1550 г. и Дворовая тетрадь 50-х годов XVI в. М.; Л., 1950. С. 80, 198).
Летом 1552 г. наместник в Рославле (Пашкова Т.И. Местное управление в Русском государстве первой половины XVI века (наместники и волостели). М., 2000. С. 156).
В декабре 1553 г. в походе из Казани на Луговую сторону и Арские места назван среди стрелецких голов, которым за одержанную над казанцами победу было велено дать по деньге золотой (Разрядная книга 1475–1605 гг. Т. 1. Ч. 3. М., 1978. С. 464).
Пристав у шведских послов в июле-августе 1561 г. в Москве (Сборник Русского исторического общества. Т. 129. СПб., 1910. С. 84, 85, 86, 89, 93, 98).
20 марта 1562 г. с другими детьми боярскими поручился по князе И. Д. Бельском в 10 тыс. руб. (Антонов А.В. Поручные записи 1527–1571 годов // Русский дипломатарий. Вып. 10. М., 2004. С. 17).
В Полоцком походе 1562/63 г. был в приставах у жены Довойны, спал в стане государя (Книга Полоцкого похода 1563 г. (Исследование и текст) / Подг. текст К. В. Петров. СПб., 2004. С. 50, 77).
С другими детьми боярскими 20 апреля 1563 г. поручился по князе А. И. Воротынском в 15 тыс. руб. (Антонов А.В. Поручные записи 1527–1571 годов // Русский дипломатарий. Вып. 10. М., 2004. С. 24).
В декабре 1563 г. был среди дворян, присутствовавших в Набережной палате Кремля во время свидания литовских послов с пленными полочанами и С. Довойной (Сборник Русского исторического общества. Т. 71. СПб., 1892. С. 287-288).
Иван Яхонтов в 1563/1564 г. писец Перемышльского уезда (Садиков П.А. Из истории опричнины XVI в. // Исторический архив. Т. III. М.; Л., 1940. С. 194).
В 1566–1579 гг. входил в Земский двор. Дворянин 1-й статьи на Земском соборе 25 июня–2 июля 1566 г. (Собрание государственных грамот и договоров. Ч. 1. М., 1813. С. 549).
В 1578/79 г. писец в Перми Великой, Чердыни, Орловского уезда, в 1578/1579 г. Соликамского уезда (Веселовский С.Б. Сошное письмо. Исследование по истории кадастра и посошного обложения Московского государства. Т. 1. М., 1915. С. 73; Т. 2. М., 1916. С. 618, 628; Акты исторические. Т. 1. СПб., 1841. С. 397; Каталог писцовых описаний Русского государства середины XV–начала XVII века / Сост. К. В. Баранов. М., 2015. С. 92).
Землевладение
В 1539/1540 г. в волости Кавь Тверского уезда деревни Перешенец, Осинники, Хвостово, Ямчищо (45 четвертей), которые находились на границе с Новоторожским уездом, были даны в поместье детям Игнатия Яхонтова, а они «били челом о поместье в Торжку.
В 1551-1554 гг. Иван Игнатьев сын Яхонтов владел с другими землевладельцами (Обалешевовыми, Коптевыми) вотчинами деревней Кузяево в волости Хорвач в Воскресенском стане и в Юрьевском стане деревнями Павлово и Селиваново (46 четвертей средней земли) (Писцовые книги Московского государства XVI в. Ч. 1. Отд. 2. СПб., 1877. С. 75, 229, 233; Писцовые материалы Тверского уезда / Сост. А. В. Антонов. М., 2005. С. 240, 245).
Иван Яхонтов до 1573/1574 г. лишился (в порозжих землях) поместья в Манатьине стане Московского уезда пустоши Павшино и других (100 четвертей доброй земли). В 1584-1586 гг. утратил (в порозжих землях) поместье в стане Манатьине Быкове и Коровине Московского уезда пустошь Гавнино и другие (125 четвертей средней земли) (Писцовые книги Московского государства XVI в. Ч. 1. Отд. 1. СПб., 1872. С. 38, 201).
В 1557/1558 г. Иван Игнатьев сын Яхонтов купил у Ивана Яковлевича Измайлова приданную вотчину его жены Ирины, дочери Степана Андреева сына Васильева, сельцо Оверкиево с 3 деревнями в Роднинской волости Старицкого уезда и деревню Трубичниково (припущена в пашню к селу Оверкиеву) в Юрьевском стане Тверского уезда за 400 руб. (Маштафаров А.В. Старицкие монастыри в документах XVI века // Русский дипломатарий. Вып. 4. М., 1998. № 1).
Послушество в земельных сделках, выступление в роли душеприказчика
Послух в данной Марии, вдовы М. И. Семенова, Чудову монастырю на село Горбуново с деревнями в Горелинском стане Зубцовского уезда в 1557/1558 г. (Кистерев С.Н. Акты московского Чудова монастыря 1507–1606 годов // Русский дипломатарий. Вып. 9. М., 2003. № 39, 44).
Вклады землевладельца в монастыри, вклады по землевладельцу родственников
В 1570/1571 г. И. И. Яхонтов дал Чудову монастырю на память по отце, по матери Марье, по братьям Андрее и Петре, по жене Евдокии сельцо Селютино с 7 деревнями (135 четвертей в поле) с пустошью и закладную вотчину Дмитрия и Андреяна Андреевых детей Ивачова половину сельца Бутово с половиной пустоши Волчищево в Клинском уезде. Послухами стоят Михайло Григорьевич Яхонтов, племянник Михаил Андреев сын Яхонтов (Антонов А.В. 1) Вотчинные архивы Московских монастырей и соборов XIV – начала XVII века // Русский дипломатарий. Вып. 2. М., 1997. № 263; 2) Клинские акты XV–XVI века // Русский дипломатарий. Вып. 4. М., 1998. № 32, 34).
