Родители
В январе 1526 г. на свадьбе великого князя Василия III и Елены Глинской его отец Федор Немой Михайлов сын Нагой нес каравай великого князя (Разрядная книга 1475–1598 гг. М., 1966. С. 10).
Отец
Нагой Федор Немой Михайлов сын
Семейные и родственные связи
Жена Семена Федорова сына Нагого Марья являлась дочерью Андакана Тушина (Архив СПб ИИРАН. Ф. 29. Оп. 1. Д. 8. № 1600. Л. 2368-2369; Писцовые книги Московского государства XVI в. Ч. 1. Отд. 1. СПб., 1872. С. 53). Дочь Федора Михайловича Нагого и сестра С. В. Нагого Екатерина вышла замуж за князя Ивана Александровича Стригина-Оболенского (Вкладная книга Троице-Сергиева монастыря. М., 1987. С. 58).
Служебная биография
В феврале 1547 г. на свадьбе царя Ивана Васильевича и Анастасии Захарьиной стлал камки перед венчанием (Разрядная книга 1475–1605 гг. Т. 1. Ч. 2. М., 1977. С. 327). Тысячник 3-й статьи из Переславля. В Дворовой тетради из Переславля (Тысячная книга 1550 г. и Дворовая тетрадь 50-х годов XVI в. М.; Л., 1950. С. 67, 138). Нагой Семен в Полоцком походе 1562/63 г. голова в наряде (Книга Полоцкого похода 1563 г. (Исследование и текст) / Подг. текст К. В. Петров. СПб., 2004. С. 44). До 1566 г. Семен Нагой был писцом в Нижегородском уезде (Акты феодального землевладения и хозяйства. Акты Московского Симонова монастыря (1506–1613 гг.). М., 1983. № 154). В феврале 1568 г. писец Залеской половины Шелонской пятины Новгорода (Акты служилых землевладельцев XV–начала XVII в. Т. 4. М., 2008. № 101). В 1569/1570 г. наместник в Рыльске. В 1571/1572 г. судья в Земском приказе в Москве. Был в поезде на свадьбе короля Магнуса и княгини Марии Владимировны Старицкой в апреле 1573 г. Во второй половине 1570-х годов входил в Особый двор Ивана Грозного. Сидел на окольничем месте на свадьбе царя и М. Ф. Нагой в сентябре 1580 г. (Разрядная книга 1475–1598 гг. М., 1966. С. 231, 233, 245, 348, 349, 378; Разрядная книга 1559–1605 гг. М., 1974. С. 83; Разрядная книга 1475–1605 гг. Т. 2. Ч. 2. М., 1982. С. 254; Т. 2. Ч. 2. С. 334; Т. 3. Ч. 1. М., 1984. С. 170; Мордовина С.П., Станиславский А.Л. Состав Особого двора Ивана IV в период «великого княжения» Симеона Бекбулатовича // Археографический ежегодник за 1976 год. М., 1977. С. 180). В 1584/85 г., 1589/90 г. воевода в Васильгороде (Разрядная книга 1475–1598 гг. М., 1966. С. 390, 436).
Землевладение
В конце XVI в. владел сельцом Тимофеевское в Тихотине стане Юрьевского уезда, которое досталось ему от отца боярина Федора Михайловича Нагого (Писцовые книги Московского государства XVI в. Ч. 1. Отд. 1. СПб., 1872. С. 856; Акты Русского государства 1505–1526 гг. М., 1975. № 25. С. 304). 24 ноября и 7 декабря 1579 г. С. Ф. Нагому было отделено поместье Г. Судакова в Рождественском погосте на Паше, во Введенском погосте на Ояти, в Никольском погосте в Ярославичах Обонежской пятины (РГАДА. Ф. 1209. Оп. 3. Д. 16933. Л. 330-339).
Вклады землевладельца в монастыри, вклады по землевладельцу родственников
3 июня 1557 г. по Марье, жене Семена Федоровича Нагова, Петр Федорович Наумов дал Троице-Сергиеву монастырю 50 руб. В 1575/1576 г. С. Ф. Нагой по жене Марье и по себе дал вотчину в Московском уезде 2 деревни на р. Всходне и 3 мельницы общей стоимостью в 50 руб. (Вкладная книга Троице-Сергиева монастыря. М., 1987. С. 70). В 1580/1581 г. Семен Федорович Нагой дал Иосифо-Волоколамскому монастырю по матери Евдокии 10 руб. (Титов А.А. Вкладные и записные книги Иосифова Волоколамского монастыря XVI в., С. 105; Приходо-расходные книги Иосифо-Волоколамского монастыря 70-80- гг. XVI в. Вып. 1. М.; Л., 1980. С. 188). В 1575/1576 г. дал Троице-Сергиеву монастырю в Горетове стане Московского уезда деревни Городище и Наумово, вотчину приданную своей жены Марьи, дочери Андакана Тушина. А взял сдачи 50 руб. Послухи Афанасей и Андрей Федоровы дети, Ивана Григорьевич, Михайло и Афанасей Александровичи, Иван Семенович Нагие. По писцовым книгам 1590-х гг. в указанном владенье было немного более 275 десятин (Писцовые книги Московского государства XVI в. Ч. 1. Отд. 1. СПб., 1872. С. 53; Архив СПб ИИРАН. Ф. 29. Оп. 1. Д. 8. № 1600. Л. 2368-2369). В 1600/1601 г. С. Ф. Нагой дал Можайскому Богородицкому Лужецкому монастырю вотчину четверть сельца Перхушково на. Р. Медведке в Медведском стане Московского уезда. Отмечено, что С. Ф. Нагой был сослан в опале. Остальную часть сельца с деревней Никольское и пустошами С. Ф. Нагой, видимо, передал сыну, а тот внуку стольнику В. И. Нагому (Записные вотчинные книги Поместного приказа 1626–1657 гг. / Сост. А.В. Антонов, В.Ю. Беликов, А. Берелович, В.Д. Назаров, Э. Тейро. М., 2010. С. 451