Дата рождения / первого упоминания в источниках
В 1529/30 г. писал деловую Скобельцыных в Вышгородском стане Дмитровского уезда (Акты служилых землевладельцев XV – начала XVII века. Т. 1. М., 1997. № 260. С. 234).
Дата смерти / последнего упоминания в источниках
Погиб во время опричного разгрома Новгорода зимой 1569/70 г. (Скрынников Р.Г. Опричный террор. Л., 1969. С. 280).
Отец
Бабкин Михаил Андреевич (Писцовые книги Новгородской земли. Т. 4. М., 2004. С. 391, 392).
Семейные и родственные связи
Дядя: Бабкин Гаврила Андреевич. Братья: Бабкин Василий Михайлович. Бабкин Данила Михайлович. Бабкин Андрей Михайлович. Двоюродные братья: Бабкин Никита Гаврилович. Бабкин Григорий Гаврилович. Бабкин Андрей Гаврилович. Бабкин Федор Гаврилович. Бабкин Иван Гаврилович.
Служебная биография
19 февраля 1546 г. Афанасий Бабкин (без указания чина) и подьячий Нечай Игнатьев были посланы в Деревскую и Бежецкую пятину для описания пустых дворов, которые предстояло освободить от ямчужной повинности (Акты, собранные в библиотеках и архивах Российской империи Археографической экспедицией императорской академии наук. Т.1. СПб., 1836. № 205/I, II. С. 185, 191-194). В сентябре 1555 г. дворцовый дьяк, получил грамоту о своевременной присылке в столицу налогов, собранных с Новгородской земли. 1 февраля 1556 г. был прислан повторный указ, так как предыдущий не был исполнен (Дополнения к Актам историческим, собранные и изданные Археографической комиссией. Т. 1. СПб., 1846. № 94. С.146-147). 10 января 1556 г. дворцовый дьяк, получил грамоту об организации сбора налогов. 20 января последовал новый указ, так как прежний не был надлежащим образом выполнен (Дополнения к Актам историческим, собранные и изданные Археографической комиссией. Т.1. СПб., 1846. № 93. С.144-146). В 1557/58 г. по его грамотам отделены поместья в Бежецкой пятине (Писцовые книги Новгородской земли. Т. 3. М., 2001. С. 77, 82). В 1558/59 г. по его отдельной отделено поместье в Деревской пятине (Писцовые книги Новгородской земли. Т. 5. М., 2004. С. 415). 2 июня 1559 г. писал царю о приезде в Новгород и проезде далее в столицу шведского гонца Матвея. 4 июня 1560 г. писал царю о предстоящем приезде в Новгород шведского гонца Ивана Ларсена. 16 июля 1560 г. писал царю о приезде в Новгород и проезде далее в столицу шведского гонца Ивана Ларсена. 7 сентября 1569 г. сын боярский Афанасий Бабкин встретил на границе шведское посольство еп. Павла Абовского. 20 сентября и 3 октября пристав Афанасий Бабкин обеспечивал ведение переговоров между дипломатами и новгородским наместником кн. П. Пронским (Сборник РИО. Т. 129. СПб., 1910. С. 62, 73, 174, 175, 176). 17 октябре 1569 г. в жалованной подтвердительной грамоте Корнилиеву Комельскому монастырю на угодья в Вологодском уезде упоминается память дьяка Афанасия Михайлова, по которой выдана жалованная грамота (Шумаков С.А. Обзор Грамот Коллегии экономии. М., 2002. Вып. 5. С. 209).
Землевладение
Имел поместья в Шелонской и Деревской пятинах Новгородской земли. В 1542/43 г. Михаил Андреевич Бабкин с сыновьями Афоней и Васюком владели поместьем в Пироском погосте Деревской пятины (Писцовые книги Новгородской земли. Т. 4. М., 2004. С. 391, 392). 25 обеж. В Дубровенском погосте Шелонской пятины владел деревней Головица и ещё 4 деревнями (всего 4,5 обжи) (Писцовые книги Новгородской земли. Т. 6. М., 2009. С. 57). В Струпенском погосте Шелонской пятины имел 5 деревень (17 обеж) (Новгородские писцовые книги, изданные Археографической комиссией. Т. 4. СПб., 1886. Стлб. 561).
Вклады землевладельца в монастыри, вклады по землевладельцу родственников
7 сентября 1546 г. Афанасий Михайлов Бабкин дал Троице-Сергиеву монастырю 10 руб., 15 марта 1550 г. – ещё 5 руб. (Вкладная книга Троице-Сергиева монастыря. М., 1987. С.103).
Другие сведения
В 1529/30 г. Афанасий Михайлов Бабкин писал деловую Скобельцыных в Вышгородском стане Дмитровского уезда (Акты служилых землевладельцев конца XV – начала XVII в. Т. 1. М., 1997. № 260. С. 234).
Генеалогическое древо
Источники для реконструкции родословной

Антонов А.В. Частные архивы русских феодалов XV – начала XVII века. № 981, 1509, 3230 // Русский дипломатарий. Вып.8. М., 2002.

Писцовые книги Новгородской земли. Т. 4. М., 2004. С. 391, 392.

Писцовые книги Новгородской земли. Т. 5. М., 2004. С.175-179, 193, 216-217.